Cell | 染色质激活或抑制作用状态决定了核小体分离的差异性

2021-10-12 18:37:58 来源:
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丝氨酸构件通过倡导或诱发该构件的RNA可以遏制突变组的特性和细胞身份认定。这些丝氨酸构件中就会存在特定的鸟嘌呤翻译后修饰(posttranslational modifications,PTMs),它们与特定RNA完全关的,并可倡导诱发性基因构件的形成,不良影响突变的表达。为了在增殖时依然保持突变表达程序的可用性,新的考虑丝氨酸构件的分子特征也必需在子代细胞中就会成立。成立各不常为同类型号丝氨酸完全的重要新的考虑因素是鸟嘌呤PTMs,都由要存在于鸟嘌呤H3和H4的脚掌上。因此,在增殖的全过程中就会,除了DNA脱氧核糖核酸,子代核小体也必需重建,并均等到子代细胞中就会。确实,深入研究推断出子代的经典鸟嘌呤(比如脱氧核糖核酸依赖的鸟嘌呤)就会在脱氧核糖核酸叉后迅速新的组装。各不常为同的深入研究组推断出H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂基因突变。然而,这两个鸟嘌呤修饰都是与诱发性丝氨酸构件关的。那么,子代中就会的核小体,以及它们携带的鸟嘌呤PTMs确实都能基因突变到子代细胞不尽常为同的突变正中央上呢?来自纽约大学兰戈恩医学中就会心的Danny Reinberg教授课题组在Cell发表深入研究Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication,该深入研究推断出在DNA脱氧核糖核酸时,诱发与深受诱发丝氨酸范围内的核小体除去是各不常为同的。深受诱发丝氨酸构件中就会的核小体就会被收容在子代细胞不尽常为同的突变范围内,而诱发型号丝氨酸构件中就会的核小体的均等则是辐射和随机的。为深入研究核小体的除去持续性,历史学者在候选突变正中央都将标识鸟嘌呤H3.1和H3.2,以锁定激素体细胞生殖细胞中就会核小体在增殖时的变化。简单来说,该方法通过位处蛋白标识技术,利用CRISPR为特定突变正中央的H3.1和H3.2手拿NAD标识,经ChIP-qPCR检查该NAD标识在有丝分裂G1期和S期的稀土元素,以反应核小体的除去持续性。若该亚基H3.1和H3.2上的NAD标识在一次增殖后下降一半,详述该核小体被收容在了两个子代细胞的不尽常为同突变正中央上;若该NAD修饰很快遗忘,详述子代细胞未有基因突变该突变正中央的核小体。历史学者首先检查了在体细胞生殖细胞中就会沉默表达的Hoxc6, Ebf1, Meis2突变的核小体除去持续性。这些突变正中央的核小体NAD水平随增殖慢慢地减至,这提示深受诱发的突变正中央的核小体就会被收容在子代细胞的不尽常为同位置。这与前人推断出的H3K9me3和H3K27me2/3可通过有丝分裂基因突变的情况常为可知。那么,诱发型号丝氨酸范围内的核小体又是如何除去的呢?历史学者检查了在体细胞生殖细胞中就会被诱发表达的Ccna2, Nanog和Pou5f1突变,推断出该突变正中央的NAD标识在增殖后黄绿色辐射完全,稀土元素很低,这提示对于诱发型号丝氨酸范围内来说,子代核小体不能粗略的均等到子代细胞常为应的突变正中央,而是随机均等的。更有趣的是,在诱发体细胞生殖细胞分化时,Hoxc6突变由诱发转为诱发,它的核小体均等模式也由粗略的同亚基均等更名随机均等。这详述子代核小体的局部均等,可以反映该丝氨酸范围内的活性完全。总的来说,该深入研究通过CRISPR引导的鸟嘌呤NAD标识子系统,深入研究了核小体在增殖全过程中就会的均等方式,并推断出诱发与深受诱发的丝氨酸范围内的核小体均等方式的各不常为同。值得注意的是,在有丝分裂的S开端,深受诱发的丝氨酸范围内的脱氧核糖核酸要晚于诱发型号丝氨酸范围内。这个等待时间歧相类也造成常以丝氨酸的脱氧核糖核酸速率大于相类丝氨酸。相类丝氨酸常为对较慢的脱氧核糖核酸速度不太可能情况下了核小体的粗略均等,而常以丝氨酸中就会的PTMs则由常为应的都由恒定位点(master regulators)直接识别常为应DNA序列,并招募PTMs酶新的成立。更早出处:Escobar TM1, Oksuz O1, Salda?a-Meyer R1, et al.Active and Repressed Chromatin Domains Exhibit Distinct Nucleosome Segregation during DNA Replication.Cell. 2019 Oct 31;179(4):953-963.e11. doi: 10.1016/j.cell.2019.10.009.
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