Cell Res：北京基因组所携手揭示 RNA 甲基化调控 R -loop 形成及转录终止

R-loop 是一种由 RNA：DNA 杂合末端和单末端 DNA 组成的特殊脱氧核糖核酸结构上，在原核和细胞器生物的基因组里面分布尤其且普遍存在。R-loop 在很多关键的病理学过程里面发挥作用重要功用，以外体细胞去除、酪氨酸调控、DNA 破损复原以及基因组稳定度等，但其如何被精准调控的系统已为不确实。m6A 去除作为旅行者 RNA 上丰度略低于的去除类别，尤其加入哺乳动物的发育、免疫、干细胞更新、脂肪分化、以及生成和移往等永生过程。然而，目前已为不确实 m6A 是否能作为 R -loop 里面 RNA 等量的本源特征来调控 R -loop 水平，进而发挥作用各种病理学功用。里面科院北京基因组研究课题所杨运桂、任捷与清华大学生科院孙前文工作团队合作研究课题，辨认出 m6A 能稳定 R-loop 的转变成，进而调控基因酪氨酸的有效暂时里面止。这一成果以《m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination》为题于 10 月 12 日在线发表于《细胞研究课题》（Cell Research）时代周刊。研究课题工作团队首先通过斑点分子可亲本和免疫荧光高效率，辨认出敲低 m6A 甲基移往酶 METTL3 显着降低 R -loop 水平，且该调控发挥作用作用依赖于 METTL3 甲基移往酶活性。随后，工作团队成员依靠高效液相色谱倡议质谱高效率，辨认出相对于于染色体结合的 RNA（caRNA），R-loop 的 RNA 等量有更加富集的 m6A 去除。进一步依靠基于单末端 DNA 建库的 DNA：RNA 杂合末端免疫共沉淀高通量基因组高效率（ssDRIP-seq），辨认出下调的 R -loop 主要富集在酪氨酸暂时里面止区域，R-loop 推移层面与 m6A 的距离和去除水平相关。为了冒险 m6A 对 R -loop 调控的病理学功用，研究课题工作团队画了 RNA 一氧化氮酪氨酸位点的高分辨率著者，并在 MYC、ACTIN 基因上进行多种酪氨酸活性检测，辨认出 m6A 有利于 R -loop 转变成是酪氨酸暂时里面止前期的于在，可以防范 RNA 一氧化氮的酪氨酸通读。再一，工作团队成员协作了针对酪氨酸通读的报告基因系统，通过 m6A 去除位点的突变进一步证实 m6A 对于 R -loop 转变成及酪氨酸暂时里面止的关键发挥作用作用。该研究课题辨认出了 m6A 底物去除的共酪氨酸调控功用，阐述了 RNA 底物去除对体细胞结构上的影响，以及 R-loop 结构上里面的 RNA 等量被去除后对其自身参量的调控系统，阐释了 m6A 通过稳定 R-loop 而有利于酪氨酸正常暂时里面止的现象，为进一步研究课题 m6A 与 R-loop 的调控系统和相应病理学功用提供了基本的高效率和理论支撑。该研究课题得到了里面国科学院战略性先导科技专项、国际组织自然科学以及国际组织重点高效率开发计划等基金资助。早期记事：Xin Yang， Qian-Lan Liu， Wei Xu， et al. m6A promotes R-loop formation to facilitate transcription termination. Cell Research (2019).